Desde mi punto de vista de desarrollador y con la experiencia de instalar tanto joomlas como drupal varias veces y haber parcheado y extendido algunos modulos tanto de joomla como de drupal, aca va mi opinion personal..
Drupal:
- la instalacion me parecio coherente y rapida a mi, esta buena la opcion de perfiles de instalacion y la separacion que los tipos hacen de carpetas..
- tienen una comunidad de mierda, todos estan para hacer el pesito... si posteas algo en el foro enseguida te saltan los so called experts a contestarte algo medio indecifrable y ver si te enganchan para que les pagues... en el IRC una sola ves logre que me contestaran una duda..
- desarrollar para drupal tiene una curva de aprendizaje muy grande, la mas grande con la que personalmente me he enfrentado hasta ahora con respecto a los cms.
- documentacion pobre comparando con wordpress por ejemplo.
- es comodo de desarrollar una ves que se le agarra la mano, pero es bien cuadrado y dificil salirse de los estandares de drupal.. eso hace que x un lado los desarrolladores mantengan un cierto estandar y sea facil entender y extender los modulos y x otro lado limita un poco el extender los modulos.
En general mientras se desarrolle dentro de la cajita de drupal se hace a los pedos y facil una ves que se le agarra la mano a drupal y su forma de hacer las cosas..
Joomla:
- instalarlo es click click click, pero una poronga para cambiar el idioma de una instalacion x ejemplo.., pide demasiados datos.
- tiene comunidad (?), se que tienen foros pero siempre me dio la impresion de que no es el lugar como para preguntar cosas tecnicas, que estan mas bien para dar soporte de usuario.
- cuando precise vichar la documentacion la encontre y me soluciono el problema de toque recuerdo... no tengo quejas pero tampoco la use mucho...
- es espantoso para desarrollar, uno encuentra cada flan y espaguetti de codigo adentro.. 0 estandar.. html y php todo junto.. un horror..
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Desde mi punto de vista mas de usuario y administrador del sitio, habiendolo nomas usado para desarrollar y configurarlo.. y nunca como usuario final.
Drupal:
- aprender a usarlo me costo mas que aprender a usar joomla y ni que hablar wordpress, una ves que le agarre la mano es comodo y todo esta donde tiene que estar
- x lo general es bien cuadradito de disenio y hasta medio feucho.. todos los sitios son medio iguales me da la impresion..
- lo volveria a usar...
Joomla:
- no lo volveria a usar si tengo la posibilidad de elegir
- es lento
- es intuitivo de usar como administrador, sin embargo tiene todo medio mezclado con respecto a modulos
- me dio algunos lios de versiones e idiomas entre modulos e instalaciones
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Mas como webmaster o sysadmin, habiendo tenido varios lios con ambos..
Drupal:
- es comodo de mover/migrar y backupear
- soporta multiples sitios en una misma instalacion, si bien no esta recomendado..
- la notificacion de los updates funciona muy bien, instalar los updates es medio penal si se hace siguiendo todos los pasos recomendados... es un clavo tener que deshabilitar todos los modulos cada ves que se updatea uno.. y volver a habilitarlos..
- es capaz de dejar un servidor de rodillas, ya sea corriendo un cron nomas o por que algun modulo esta tirando fruta..
- la performance decrese jodido a medida q se le instalan modulos.. y no escala del todo bien con el trafico, pero que cms escala bien (?), tiene buenos modulos para cache y throttle, ademas de mucha informacion sobre escalabilidad y clusterizacion que le salva el dia..
- en cuanto a seguridad, tienen updates semanales y no he tenido problemas, me acuesto a dormir sin miedo
Joomla:
- la estructura y forma que tienen para instalar modulos termina teniendo pedazos de modulo x todos lados..
- las migraciones son un penal.. varios problemas he tenido.. tanto x distintas versiones, como x rutas y modulos..
hades puede dar fe de esto
- no se respeta mucha convencion en nada...
- nunca tube hasta ahora la oportunidad de trabajar con un joomla que necesitara escalar.. de todas formas no me hago la idea de que escale bien..
- seguridad, what seguridad? hagan una busqueda en:
http://www.milw0rm.com/search.php x joomla y otra x drupal
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En mi opinion personal, entre Joomla y Drupal, toda la vida me quedo con drupal, pero es como elejir entre cancer de colon y cancer de piel... :P
Wordpress esta mucho mejor

y sigue siendo el rey de los cms

si, si.. dije bien.. Wordpress es un cms..
una ves mas y para evitar herir sensibilidades y entrar en un terreno que no me interesa entrar, es mi opionion personal, no soy duenio de la verdad absoluta y lo que digo esta basado en mi experiencia con ellos ya sea utilizandolos/desarrondolos/usuario..y puedo estar equivocado.